Новинка, по сравнению с собратьями, имеет базовый набор характеристик, тем не менее стоит выделить наличие разъемов M.2 (для PCI-E SSD) и SATA Express, аудиоподсистемы Crystal Sound 2 на базе контроллера Realtek ALC1150 и десяти каналов USB 3.0 (шесть портов на задней панели). Помимо этого, Asus X99-A допускает установку процессоров Core i7-5800/5900, восьми модулей оперативной памяти DDR4-2133/.../3200 общим объемом до 64 ГБ, трех видеокарт Nvidia или AMD (SLI/CrossFireX по формуле x16/x16/x8).
Также на плате присутствуют: восемь портов SATA 6 Гбит/с, шесть из которых поддерживают организацию RAID-массивов уровней 0, 1, 5 и 10, единичный разъем PCI-E 2.0 x16@x4, пара PCI-E 2.0 x1, гигабитный сетевой контроллер Intel I218V и индикатор POST-кодов. Сокет LGA2011-3 запитан от восьми фаз.
Подробные характеристики модели Asus X99-A приведены по ссылке.